Susceptibilité liée à l’âge à l’infection par Escherichia coli diarrhéique chez les nourrissons des zones périurbaines à Lima, au Pérou

ContexteLes souches d’Escherichia coli diarrhéiques sont reconnues comme des entéropathogènes pédiatriques importants dans le monde. Cependant, on ne sait pas s’il existe des différences de sensibilité à des souches spécifiques, en particulier chez les nourrissons.Nous avons mené une étude de cohorte de surveillance passive de la diarrhée chez des enfants âgés de Des échantillons de selles de contrôle ont été prélevés chez des enfants choisis au hasard sans diarrhée. Tous les échantillons ont été analysés pour rechercher des agents pathogènes entériques communs et des E coli diarrhéiques avec utilisation de la réaction en chaîne par polymérase multiplex en temps réel.RésultatsLes pathogènes les plus fréquemment isolés dans les épisodes diarrhéiques étaient les souches diarrhéiques E coli. Les E coli entéropathogènes et les infections à E. coli diarrhéiques, les espèces Campylobacter et les rotavirus ont été plus fréquemment isolés chez les nourrissons âgés de ⩾ mois. Chez les nourrissons plus âgés, E coli et E coli entérotoxinogènes ont été plus fréquemment isolés des diarrhées. exemples que d’échantillons témoins P & lt; Les enfants âgés de ⩾ mois qui ont été infectés par E. coli entérotoxinogène présentaient un risque multiplié de diarrhée, un intervalle de confiance inférieur à celui des enfants plus jeunes. La diarrhée persistante était plus fréquente chez les nourrissons de moins de 16 ans. mois% vs%; P & lt; Parmi les enfants ayant des échantillons positifs pour E coli diarrhéique, les co-infections avec d’autres pathogènes étaient plus fréquentes chez les enfants souffrant de diarrhée que chez les enfants témoins% vs%; P & lt; Conclusions Des souches d’E. Coli diarrhéiques ont été plus fréquemment isolées dans des échantillons de nourrissons plus âgés. Dans ce contexte où la fréquence d’exposition aux agents pathogènes est élevée et la fréquence d’allaitement élevée, nous supposons que les principales différences liées à l’âge résultent d’une diminution des facteurs de protection. de l’exposition accrue aux aliments et à l’eau contaminés

La diarrhée est la troisième cause de décès la plus fréquente chez les enfants. Les souches d’Escherichia coli diarrhéiques sont responsables de% -% des cas de diarrhée aiguë chez les enfants et sont reconnues comme des agents pathogènes importants, même dans le monde développé Une étude récente de l’Organisation mondiale de la Santé, E.coli coli entéropathogène et E coli entérotoxigène ETEC ont été classées comme prioritaires pour le développement de vaccins après le rotavirus en raison de leurs taux de morbidité et de mortalité élevés Les E coli associés à la diarrhée ont été classés en groupes. sur des critères cliniques, épidémiologiques et moléculaires: EPEC; ETEC; Le STEC E coli producteur de Shiga toxine, également appelé E coli entérohémorragique ou E coli producteur de toxine Vero; E coli entéro-invasive; E coli entéroagrégatif EAEC; E.coli DAEC Chaque groupe a des facteurs de virulence spécifiques qui sont utilisés pour l’identification et la classification, et chaque groupe a des sérotypes spécifiques. Cependant, à l’exception de STEC en particulier E coli: H, les souches E coli diarrhéiques ne sont pas systématiquement recherchées. La plupart des laboratoires cliniquesLa charge de morbidité majeure et les taux de mortalité les plus élevés surviennent au cours de la première année de vie Cependant, en raison du nombre limité d’études menées auprès de cette population , on ne sait toujours pas susceptibilité à l’infection par E. coli diarrhéique au cours de la première année de vie Les objectifs de cette étude étaient de déterminer si l’isolement des souches diarrhéiques d’E. coli et d’autres pathogènes communs est associé à la diarrhée chez les nourrissons péruviens. l’âge, afin de déterminer s’il existe d’importantes différences liées à l’âge et de décrire les cours cliniques spécifiques aux agents pathogènes

Patients et méthodes

Conception de l’étude Cette étude de cohorte prospective sur la diarrhée a été menée dans des communautés à faible statut socioéconomique dans les districts périurbains de Lima, Chorrillos, Villa El Salvador, Villa Maria de Triunfo et San Juan de MirafloresPatients Un recensement maison par maison a été effectué par des agents de terrain qualifiés. et les enfants ont été identifiés et inscrits à la clinique de l’étude à Chorrillos après l’obtention du consentement éclairé de leurs parents. L’inscription a eu lieu à l’âge de la naissance, car c’est l’âge auquel les enfants étaient inscrits pour un vaccin coïncident. essai clinique nouvelle formulation d’un vaccin pédiatriqueDéfinitions La diarrhée a été définie comme suit: st selles liquides ou semi-liquides passées dans une période -h ou ⩾ selles liquides avec du sang Un épisode diarrhéique était considéré comme ayant débuté le jour où la ont pris fin le dernier jour de la diarrhée suivi de ⩾ jours consécutifs pendant lesquels l’enfant ne répondait pas à la définition de di arrhea Diarrhée persistante a été définie comme la diarrhée qui a duré & gt; La surveillance de la diarrhée La présente étude était une étude de surveillance passive. On a demandé aux parents d’amener l’enfant à la clinique chaque fois que l’enfant a eu une diarrhée nécessitant des soins médicaux. évaluer les caractéristiques de l’épisode diarrhéique Un score de Vesikari modifié a été utilisé pour déterminer la sévérité des épisodes Le score incluait la durée de la diarrhée – points, nombre maximum de selles par jour – nombre de jours de vomissements -, nombre maximum d’épisodes de vomissements par jour -, présence de fièvre -, déshydratation -, et traitement – Un score faible était – points, un score modéré était – points, et un score sévère était – points Nous avons essayé d’obtenir un échantillon de selles de tous les enfants qui ont été vus pour des épisodes diarrhéiques à la clinique d’étude et des enfants dont les épisodes ont nécessité une hospitalisation ou une visite ambulatoire en dehors de notre clinique d’étude. Une solution de réhydratation orale et des antibiotiques ont été fournis si nécessaire, ainsi que des conseils concernant la prise en charge diététique. Pour tous les épisodes diarrhéiques détectés, un formulaire d’étude a été rempli à la clinique et les parents ont reçu un formulaire pour enregistrer les symptômes quotidiens. Un échantillon de selles a été prélevé sur des nourrissons inscrits alors qu’ils étaient en bonne santé, définis comme l’absence de diarrhée une semaine avant et après la collecte de l’échantillon de selles témoins, afin d’évaluer la colonisation. Cinq cent seize enfants ont été sélectionnés au hasard. Des échantillons de selles ont été obtenus à,,,,,,,,, et mois. Un agent de terrain a visité ces enfants à la maison pour recueillir ces échantillons. Études de laboratoire Des échantillons de selles ont été inoculés dans des flacons moyens et propres de Cary-Blair. Le laboratoire a analysé la présence de virus entériques, de bactéries et de parasites à l’aide de Techniques conventionnelles et moléculaires L’immunosorption enzymatique a été utilisée pour le rotavirus; l’examen direct a été utilisé pour les œufs de parasites; et des cultures de selles de routine ont été utilisées pour détecter les espèces de Salmonella, Shigella, Campylobacter et Vibrio. On a utilisé la réaction en chaîne par polymérase en temps réel multiplex PCR pour la détection de E. coli diarrhéique; les colonies de fermentation du lactose suggérant E coli provenant de chaque plaque McConkey ont été analysées pour la présence des gènes diagnostiques de E coli diarrhéique: aggR EAEC; st, st et lt ETEC; eae EPEC; eae, stx et stx STEC; ipaH entéroinvasive E coli; et daaD DAEC Toutes les souches EPEC isolées ont été évaluées pour la présence de bfp A dans une PCR séparée Les souches eae / bfp étaient considérées comme des EPEC typiques, alors que les souches eae / bfp étaient considérées comme atypiques EPECData analysis l’association des différences d’âge & lt; mois en fonction de l’incidence de la diarrhée en calculant l’incidence individuelle de la diarrhée pour chaque enfant pour chaque catégorie d’âge et en utilisant le test t apparié de l’élève Pour tenir compte du regroupement intra-individuel des échantillons de selles et des épisodes diarrhéiques, nous Nous avons utilisé la régression linéaire à effets aléatoires pour tester l’association des différences d’âge avec la proportion de cas de diarrhée persistante, la proportion d’épisodes dans lesquels au moins Nous avons utilisé la régression logistique à effets aléatoires Toutes les analyses statistiques ont été effectuées à l’aide de Stata, version Stata P & lt; a été considéré comme statistiquement significatif. Considérations éthiques L’étude a été approuvée par le Comité d’éthique. Conseil d’examen de l’Instituto de Investigación Nutricional, de l’Universidad Peruana Cayetano Heredia et de la Na Détachement du Centre de recherche médicale de Val

Résultats

Un total d’enfants péruviens ont été suivis de septembre à décembre. Quarante-deux enfants ont été perdus de vue et seuls leurs jours observés ont été analysés. Les enfants restants ont été censurés administrativement lorsque la clinique d’étude a été fermée dapoxetinefr.com. avec les épisodes diarrhéiques détectés Quarante-trois pour cent des épisodes étaient chez les enfants & lt; L’âge de la diarrhée nécessitant des soins médicaux était des épisodes par enfant par an La durée moyenne des épisodes diarrhéiques ± écart-type était de ± jours Il y avait des enfants% sans épisodes diarrhéiques,% avec épisode,% avec épisodes,% avec épisodes,% avec des épisodes, et% avec & gt; épisodes nécessitant des soins médicaux, l’enfant a eu des épisodes La comparaison des données de surveillance de la diarrhée chez les enfants & lt; L’incidence et la durée de la diarrhée étaient significativement plus élevées chez les nourrissons plus jeunes. Il y avait des épisodes de diarrhée persistante%, avec une proportion plus élevée d’épisodes persistants chez les enfants plus jeunes. Cependant, la fréquence d’isolement des Les caractéristiques sociodémographiques de ces enfants sont décrites dans le tableau. Il est intéressant de noter que% des enfants étaient exclusivement nourris au sein à l’âge de quelques mois et que% d’entre eux avaient été allaités à des mois.

Table View largeTélécharger un diaporamaDiarrhée Données de surveillance pour les enfants péruviensTable View largeTélécharger un diaporamaDiarrhée Données de surveillance pour les enfants péruviens

DiapositiveDimension Caractéristiques de l’enfant dans la table d’étude Voir grandDisque de téléchargement Caractéristiques sociodémographiques des enfants de l’étude Neuf cent trente-six échantillons de selles ont été recueillis pendant la diarrhée% de tous les épisodes, et des échantillons de contrôle ont été prélevés chez des enfants sans diarrhée. Parmi les EI coli diarrhéiques, les EAEC% et les EPEC% étaient les plus communs. Tous les agents pathogènes étaient plus fréquemment isolés chez les nourrissons plus âgés ⩾ mois que chez les plus jeunes. les nourrissons P & lt; L’EPEC atypique était beaucoup plus commun que l’EPEC typique; Parmi les souches d’ETEC, les ETEC thermolabiles étaient les souches les plus communes [%] de souches, suivies par les ETEC thermostables [%] et thermolabiles et la chaleur. -stable ETEC [%] de toutes les souches de STEC étaient présentes et stx; Il n’y avait pas de souches sclérosantes. Aucun E. coli entéro-invasif, Vibrio cholerae ou parasites intestinaux n’ont été détectés. Le taux d’incidence de tous les E coli diarrhéiques était des épisodes par enfant et par an; les taux d’incidence par groupe d’âge pour chaque pathogène sont répertoriés dans le tableau

Tableau View largeTélécharger slidePathogènes Isolés de Diarrhée et de Contrôle Échantillons sans Diarrhée de Enfants PéruviensTable View largeTélécharger slidePathogènes Isolés de Diarrhée et de Contrôle Échantillons sans Diarrhée d’Enfants Péruviens

TableauTaille largeTélécharger Diapositive Taux d’incidence par groupe d’âge pour chaque pathogène isolé dans la diarrhée EpisodesTable AgrandirDisque de téléchargementTaux d’incidence par groupe d’âge pour chaque pathogène isolé dans les épisodes de diarrhéeLa comparaison des taux d’isolement entre les échantillons d’enfants diarrhéiques et d’enfants témoins montre que tous les pathogènes sont isolés à des taux similaires, à l’exception des groupes: ETEC, DAEC et espèces de Campylobacter ETEC et DAEC étaient plus fréquemment isolés des échantillons diarrhéiques que des échantillons témoins des nourrissons plus âgés. En revanche, l’infection à Campylobacter était significativement associée à la diarrhée chez les nourrissons plus jeunes, bien que la fréquence de l’infection augmentait avec l’âge Les enfants âgés de ⩾ mois qui étaient infectés par ETEC présentaient un risque accru de diarrhée% d’intervalle de confiance [IC], -; P =, comparé aux enfants plus jeunes Dans le même groupe d’âge, les enfants infectés par DAEC avaient un risque accru de diarrhée% CI, -; P = Les co-infections étaient fréquentes, représentant% des échantillons diarrhéiques et% des échantillons témoins P & lt; Chez les enfants témoins, les co-infections les plus fréquentes étaient les cas de rotavirus et d’EAEC, les cas de rotavirus et de Campylobacter et les cas de Campylobacter et d’EAEC Parmi les enfants témoins, les coïnfections les plus fréquentes étaient les cas de Campylobacter et d’EAEC et les cas d’EPEC. échantillons, les co-infections avec d’autres pathogènes étaient significativement plus fréquentes dans les échantillons de diarrhée que dans les échantillons témoins% vs%; P & lt; Figure

Figure View largeTélécharger les infections mixtes dans lesquelles une souche diarrhéique d’Escherichia coli a été isolée dans les échantillons de diarrhée et de contrôle Les barres noires indiquent le pourcentage de coïnfections parmi les échantillons de diarrhée pour chaque groupe diarrhéique E coli: tous E coli n =, E. coli entéroagrégatif EAEC; n =, E. coli entéropathogène EPEC; n =, E coli entérotoxigène ETEC; n =, et E coli DAEC diffusant de manière diffuse; n = Les barres blanches indiquent le pourcentage de coinfections parmi les échantillons témoins: tous E coli n =, EAEC n =, EPEC n =, ETEC n =, et DAEC n = * P & lt; et ** P & lt ;, pour la comparaison des coïnfections entre Diarrhée et contrôle des échantillons pour chaque agent pathogène Les données sur les E. coli productrices de toxine de Shiga ne sont pas montrées en raison de leur petit nombre.Infections mixtes dans lesquelles une souche diarrhéique d’Escherichia coli a été isolée dans les échantillons de diarrhée et de contrôle Les barres noires indiquent le pourcentage de coïnfections parmi les échantillons de diarrhée pour chaque groupe E coli diarrhéique: tous E coli n =, E coli entéroagrégatif EAEC; n =, E. coli entéropathogène EPEC; n =, E coli entérotoxigène ETEC; n =, et E coli DAEC diffusant de manière diffuse; n = Les barres blanches indiquent le pourcentage de coinfections parmi les échantillons témoins: tous E coli n =, EAEC n =, EPEC n =, ETEC n =, et DAEC n = * P & lt; et ** P & lt ;, pour la comparaison des coïnfections entre échantillons de diarrhée et de contrôle pour chaque pathogène Les données sur les E. coli productrices de Shiga-toxines ne sont pas montrées en raison du petit nombre Dans les épisodes causés par un seul pathogène à l’exclusion des co-infections, le DAEC tend à causer des maladies plus longues. et la moitié de la fièvre impliquée Les épisodes impliquant le nombre maximum de selles molles par jour étaient ceux provoqués par EPEC, ETEC, Campylobacter et rotavirus La moitié des enfants avec ETEC a reçu une solution de réhydratation orale, qui était similaire à la proportion d’enfants infectés avec le rotavirus qui a reçu la solution; Cependant, seuls ces derniers nécessitaient des liquides intraveineux. Les épisodes de diarrhée à rotavirus étaient les plus sévères, suivis d’épisodes d’infections mixtes et de diarrhée EPEC Plus de la moitié des épisodes de diarrhée à rotavirus étaient des cas modérés ou sévères. antibiothérapie empirique

Table View largeTélécharger la lameCaractéristiques cliniques et gravité des épisodes diarrhéiques causés par un seul agent pathogène ou par de multiples agents pathogènesTable Voir grandDownloadTaractéristiques cliniques et gravité des épisodes diarrhéiques causés par un seul agent pathogène ou plusieurs pathogènes

Discussion

E coli diarrhéique La différenciation des classes, en plus de la taille de la présente étude et de l’accent mis sur les maladies plus sévères, la rend particulièrement pertinente. Dans cette étude, la CEEA était l’agent pathogène le plus répandu dans les échantillons diarrhéiques et témoins. avec plusieurs études montrant une différence dans la prévalence des CEEA entre les échantillons diarrhéiques et les échantillons témoins Cependant, l’EAEC est hétérogène Les gènes utilisés dans notre PCR multiplex sont pour un dépistage initial des souches diarrhéiques d’E. coli. L’EPEC atypique était plus commun que l’EPEC typique dans les cas de diarrhée, ce qui concorde avec les données actuelles suggérant que l’EPEC atypique est plus prévalente que l’EPEC typique dans les pays développés et en développement. pays Cependant, la fréquence de l’EPEC typique et atypique et son association avec la diarrhée aiguë, la diarrhée persistante ou Le transport ymptomatique n’est pas complètement défini Plusieurs études pédiatriques récentes ont montré que l’EPEC atypique est significativement associé à la diarrhée [,,,] Les profils de virulence complète de la plupart des souches EPEC atypiques sont inconnus Le rôle du DAEC dans les maladies diarrhéiques est controversé. Certaines études ont signalé des fréquences similaires d’isolement par rapport aux échantillons de diarrhée et témoins. Cependant, d’autres études cas-témoins ont trouvé une corrélation entre l’infection DAEC et la diarrhée, en particulier chez les enfants. Bien que DAEC ne représentait que% de nos cas, il était significativement associé à la diarrhée chez les nourrissons – mois d’âge Cette association d’âge diffère de celle des études antérieures impliquant des enfants brésiliens chez lesquels le DAEC était associé à la diarrhée chez les enfants – Dans ces études, le taux d’isolement du DAEC chez les jeunes enfants était élevé. Dans la présente étude, la prévalence d’ETEC était faible; cependant, les enfants de ⩾ mois infectés par ETEC présentaient un risque accru de diarrhée, comparé aux enfants plus jeunes. La plupart des études épidémiologiques avec des données sur les taux d’isolement par âge ont rapporté des taux de prévalence d’ETEC de% -% chez les enfants. mois d’âge [,,,,] Cependant, plusieurs études [,,] ont rapporté des taux similaires à ceux de la présente étude. En% des épisodes d’ETEC, les enfants étaient déshydratés et nécessitaient un traitement avec une solution de réhydratation orale; L’utilisation d’une solution de réhydratation orale est compatible avec la nature déshydratante de l’infection à ETEC, les taux élevés de morbidité dans le cadre communautaire et les taux élevés de mortalité en milieu hospitalier L’entérotoxine thermolabile était présente dans près des deux tiers des infections à ETEC, seules ou en combinaison avec une entérotoxine thermostable; Cependant, cette étude montre que ces pathogènes sont présents dans les communautés périurbaines de Lima, et par conséquent, les enfants pourraient potentiellement développer une maladie plus grave et des complications associées à des maladies diarrhéiques. Infection STEC Toutes les souches STEC isolées dans cette étude étaient des souches stxand eae dont on sait que seules les souches stx sont moins virulentes que celles stx L’absence d’E. Coli entéro-invasive et la faible fréquence d’isolement des espèces Shigella pourraient s’expliquer par: l’âge des patients, ainsi que la fréquence élevée de l’utilisation empirique d’antibiotiques dans cette population avant la collecte des échantillons de selles. Les infections mixtes sont un problème évolutif dans l’épidémiologie de la diarrhée Avec de meilleurs outils diagnostiques, on trouve plus d’infections mixtes. pour déterminer quel pathogène est responsable de la maladie, ou s’il y a un effet additif Des études ont révélé un nombre significativement plus élevé d’enfants atteints de diarrhée avec co-infection que les enfants témoins avec des co-infections, suggérant des associations de ces entéropathogènes potentiels dans l’étiologie de la diarrhée Dans la présente étude, les infections mixtes étaient fréquentes, Ces épisodes ont eu tendance à entraîner une plus grande déshydratation que les épisodes causés par un seul E coli diarrhéique. Il existe des limites méthodologiques dans notre étude. L’absence de parasites intestinaux pourrait s’expliquer par un volume d’échantillon de selles sous-optimal Il est possible que certains patients aient été atteints d’entérocolite virale nonrotavirale Etant donné qu’il s’agissait d’une étude de surveillance passive, nous ne disposons pas d’informations sur les maladies légères ne nécessitant pas de soins médicaux. Cette étude ne fournit donc pas d’estimation de l’incidence dans cette population Même avec ces limites Les données démontrent que diverses souches diarrhéiques d’E. coli sont courantes au Pérou et qu’elles sont associées à une diarrhée sporadique chez les enfants, nécessitant des soins médicaux.

Remerciements

Conflits d’intérêts potentiels Tous les auteurs: aucun conflit Soutien financier Instituts nationaux de la santé, Centre international Fogarty KTW à TJO et Institut national de la santé infantile et du développement humain R-HD à TGC; et le Fonds de recherche institutionnelle du Dr Lanatás, et l’unité de travail du Programme de recherche sur les maladies infectieuses militaires des États-Unis numéro B