La gastroentérite virale d’origine alimentaire: défis et opportunités

On estime que les VNR de type Norwalk sont les causes les plus fréquentes de maladies d’origine alimentaire aux États-Unis, représentant les deux tiers de toutes les maladies liées aux aliments. Les caractéristiques épidémiologiques et le fardeau de la maladie associés aux VNR étaient, jusqu’à récemment, mal compris. Cependant, l’application de techniques moléculaires pour diagnostiquer et étudier les foyers d’infection au cours des dernières années a conduit à une appréciation croissante de l’importance de ces agents. Les VNL sont la principale cause des épidémies. de vomissements et de diarrhées aiguës dans tous les groupes d’âge – le plus souvent, par la contamination d’aliments non cuits par des manipulateurs infectés, mais aussi par des aliments contaminés à leur source, tels que les huîtres et les framboises peuvent également représenter plus de% des cas sporadiques. gastro-entérite chez les enfants et les adultes Les recherches futures se concentreront sur le développement de tests diagnostiques faciles à la détection d’antigènes et d’anticorps ainsi que le développement de vaccins La mise en œuvre de mesures de prévention simples, y compris de bonnes pratiques de manipulation des aliments, continuera d’être une priorité

La gastroentérite reste l’une des causes les plus fréquentes de morbidité et de mortalité dans le monde entier. L’impact est le plus dramatique dans les pays en voie de développement où, selon les estimations, un million d’enfants sont âgés de moins de 18 ans. L’Organisation mondiale de la santé estime qu’un grand nombre de ces décès sont causés par des agents pathogènes d’origine alimentaire aux États-Unis, bien que le nombre de décès associés aux infections entériques soit faible, la gastro-entérite associée à des aliments contaminés demeure L’appréciation croissante du fardeau dramatique des maladies d’origine alimentaire aux États-Unis a suscité un intérêt accru de la part des organismes fédéraux et des organismes de santé publique et les a incités à étudier ces maladies. , pour évaluer les stratégies de prévention et pour améliorer la surveillance réglementaire de l’industrie alimentaire Une grande partie de l’attention récente a été accordée à la prévention de l’infection par des agents bactériens; On estime que les agents viraux, principalement les virus de type Norwalk, représentent plus des deux tiers des maladies d’origine alimentaire causées par des agents pathogènes connus . Les efforts pour comprendre et prévenir les gastro-entérites virales d’origine alimentaire ont été particulièrement obstacles Premièrement, aucun test de détection simple et sensible n’est disponible et l’accès aux laboratoires capables d’établir un diagnostic approprié est limité. Deuxièmement, l’absence de traitement spécifique pour la gastro-entérite virale suscite un enthousiasme limité chez les médecins et les autorités de santé publique. , même lorsque des outils de diagnostic sont disponibles Cependant, les progrès récents dans les méthodes de détection ont révolutionné notre compréhension de ces agents et leur importance, et ces progrès promettent de développer des méthodes de prévention efficaces dans les années à venir.

Les Agents: Nlvs et tout le reste

Bien que plusieurs virus aient été impliqués dans des épidémies de diarrhée d’origine alimentaire, les VNR représentent l’écrasante majorité des cas de maladies virales d’origine alimentaire. Les VNL sont un groupe de virus apparentés au nom du virus prototype Norwalk, découvert par Albert Kapikian au National. Les volontaires ont reçu des filtrats d’échantillons de selles recueillis par les épidémiologistes CDC des centres de contrôle et de prévention des maladies lors d’une éclosion de vomissements dans une école primaire de Norwalk. , Ohio, in Initialement, aucun agent n’a pu être identifié dans ces échantillons, mais les filtrats administrés aux volontaires induisaient une maladie gastro-intestinale, indiquant la probabilité d’une cause infectieuse. La découverte du Dr Kapikian marquait la première fois qu’un virus causer des maladies diarrhéiques chez l’homme Une décennie a confirmé que le virus Norwalk était une cause importante d’épidémies de gastro-entérite dans une grande variété de contextes, et les caractéristiques cliniques et épidémiologiques distinctes de ces éclosions ont servi de guide diagnostique en l’absence de tests de routine . virus de l’ARN -stranded qui étaient auparavant appelés « petits virus ronds-structurés » en raison de leur apparence sous un microscope électronique figure Ils constituent un genre dans la famille Caliciviridae et sont divisés en génogroupes distincts GI, GII et GIII, qui, à leur tour, sont divisés en ⩾ grappes génétiques De multiples souches de VNL circulent à un moment donné, bien qu’il y ait des preuves qu’une souche ou un groupe de souches peut parfois prédominer: par exemple, au milieu, une souche commune unique se propager dans une courte période de temps

Figure Vue largeDispositif de microscopie électronique du virus de Norwalk montrant des calices autour de la capside – d’où le nom de « calicivirus » Figure agrandieDownload slideDiographie par électron du virus de Norwalk montrant des calices autour de la capside – d’où le nom de « calicivirus ». causes importantes de gastro-entérite, comme les rotavirus, les astrovirus, les adénovirus et les virus SLS de type Sapporo, mais peu d’agents infectieux ont été associés à la transmission alimentaire, et rarement, les rotavirus ont parfois été impliqués dans des épidémies attribuées à des aliments contaminés. , comme une récente épidémie d’infection chez les étudiants, présumée avoir été causée par la contamination d’aliments crus préparée par un manipulateur malade . Dans le s, le rotavirus a été impliqué dans une vaste contamination d’origine hydrique à l’échelle communautaire. éclosion de gastro-entérite associée à un réservoir contaminé fournissant de l’eau potable De même, les astrovirus ont été signalés comme causes d’épidémies d’origine alimentaire et hydrique , mais ce sont des cas exceptionnels. Parmi les autres genres de SLV, Vesivirus et Lagovirus de la famille des Caliciviridae, seuls les SLV sont des causes fréquentes de Chez les humains, peu de cas de transmission par des aliments contaminés existent Dans un examen de l’étiologie des foyers de gastro-entérite non bactérienne signalés aux CDC, les VNR représentaient% des foyers étudiés pendant une période de signalés en Europe Pour cette raison, lors d’une éclosion d’origine alimentaire, les laboratoires de santé publique devraient éliminer les VNR avant d’effectuer d’autres tests de dépistage

Présentation clinique

La gastro-entérite virale associée au NLV se présente généralement comme un vomissement; diarrhée aqueuse et non sanglante; douleur abdominale; et nausées Les anciennes références à l’infection par le NLV comme « vomissements d’hiver » indiquent que le vomissement est souvent le premier symptôme et est souvent la raison pour laquelle une personne se présente pour des soins médicaux. adultes Cependant, les deux symptômes surviennent chez la plupart des patients, quel que soit leur âge. La fièvre survient chez un tiers à la moitié des patients; il est généralement de qualité inférieure et dure pour & lt; h Une variété d’autres symptômes, y compris la myalgie, les maux de tête et les frissons, sont également fréquemment signalés. Les symptômes durent généralement pendant des jours. La déshydratation demeure la complication la plus courante, surtout chez les jeunes enfants et les personnes âgées. Les décès associés à la VNL sont décrits dans le contexte de foyers d’infection, généralement chez des patients âgés résidant dans des maisons de retraite Enfin, l’infection asymptomatique est probablement assez fréquente et peut jouer un rôle important dans la transmission La gastro-entérite est suffisamment non spécifique pour rendre le diagnostic de la maladie NLV sporadique impossible pour des raisons cliniques seulement. Cependant, le contexte épidémiologique et la survenue d’autres contacts avec des maladies similaires dans les ménages, les écoles ou les lieux de travail favorisent le diagnostic. , la prédominance du vomissement en tant que symptôme initial est utile pour le diagnostic Au début des années, Kapl et ses collègues du CDC ont trouvé que des foyers de gastro-entérite répondant à des critères simples et faciles à déterminer étaient probablement causés par des VNL. Ces critères incluaient l’absence de détection d’un pathogène bactérien ou parasitaire dans les échantillons de selles. % de patients, une durée moyenne de maladie de – h, et une période d’incubation moyenne de – h Ces critères ont été particulièrement utiles en tant qu’outil diagnostique en l’absence de méthodes spécifiques de diagnostic en laboratoire, et restent largement utilisés par les services de santé locaux

Physiopathologie et immunité

Les VNR sont transmises principalement par la voie oro-fécale, soit par la consommation de nourriture ou d’eau contaminée, soit par transmission directe de personne à personne. Certaines preuves montrent que les VNR se propagent par de grosses gouttelettes ou par l’aérosolisation des vomissements. Enfin, la contamination de l’environnement a été impliquée comme un réservoir d’infection qui soutient les épidémies La transmission secondaire de personne à personne dans les épidémies d’origine alimentaire est caractéristique des VNR ; Les symptômes de la maladie de NLV commencent généralement – h après l’exposition à la VNR A ce moment, l’excrétion du virus dans les selles commence généralement, bien que l’excrétion présymptomatique puisse se produire. L’excrétion virale était traditionnellement censée cesser dans les jours suivant l’amélioration clinique, mais l’utilisation récente des méthodes de détection moléculaire indique que les antigènes viraux peuvent être trouvés dans les échantillons de selles pendant une semaine ou plus après la guérison. Infectiosité On ne sait pas comment ces découvertes influent sur les recommandations de lutte contre les infections en cas d’éclosion, en particulier en ce qui concerne l’exclusion des manipulateurs et du personnel de santé infectés du lieu de travail. sujets ont développé une immunité de courte durée, corrélée à se dans les niveaux d’anticorps sériques, mais les patients étaient sensibles à la maladie à nouveau lorsqu’ils sont réexpédiés avec la même souche & gt; ans plus tard L’immunité semble être spécifique de la souche et, étant donné la variabilité génétique des VNR circulantes, les individus sont susceptibles d’être infectés à plusieurs reprises par des VNL au cours de leur vie. D’intérêt, dans les études de provocation, les individus avec des niveaux élevés d’anticorps sériques préexistants semblent paradoxalement prédisposés à la maladie, alors qu’une proportion d’individus reste asymptomatique, avec de faibles titres d’anticorps, malgré des défis répétés Ces résultats ont conduit à des hypothèses selon lesquelles la susceptibilité à l’infection est génétiquement déterminée, par exemple, elle est déterminée par la présence d’un gène récepteur, comme c’est le cas pour le choléra

Fardeau de la maladie et caractéristiques épidémiologiques des Nlv

Des estimations précises de l’ampleur réelle de la charge de morbidité associée aux VNR ne sont pas disponibles, mais les VNL sont probablement la cause la plus fréquente d’épidémies de gastro-entérite et peuvent être la cause la plus fréquente de gastro-entérites sporadiques. milieux, y compris les maisons de soins infirmiers, les restaurants, les écoles, les garderies et les navires de croisière Les éclosions d’origine hydrique dans les collectivités ont été causées par des puits contaminés et des eaux récréatives, par exemple. de la maladie associée au VNL en Finlande La plupart des épidémies d’infection par le NLV d’origine alimentaire surviennent par contamination directe d’aliments ou d’eau par un manipulateur immédiatement avant sa consommation. Par conséquent, les aliments froids, y compris diverses salades, sandwiches et produits de boulangerie, sont classiquement impliqués dans éclosion d’infection Les aliments peuvent aussi être contaminés à la source; Les huîtres provenant d’eaux contaminées sont classiquement associées à des épidémies généralisées de gastro-entérite D’autres aliments, comme les framboises, la glace et les salades, ont également été contaminés avant d’être largement distribués et ont provoqué d’importantes épidémies de gastro-entérite.

Caractéristiques des calicivirus facilitant leur propagation dans les épidémies Bien que les critères épidémiologiques publiés permettent de classer et de signaler les poussées de gastro-entérite comme pouvant être dues signifie que ces rapports ne sont utiles que pour des estimations approximatives de la charge de morbidité La part de toutes les épidémies d’origine alimentaire définitivement attribuable aux VNL dépend directement de la qualité de la surveillance et de la disponibilité d’outils diagnostiques sensibles. On a déterminé que les analyses étaient les principales méthodes de détection des VNL. On a déterminé que le% des éclosions de gastro-entérite non bactérienne étaient associées au VNR. En utilisant des techniques moléculaires plus sensibles, on a attribué aux VNR% des éclosions de gastroentérite non bactérienne. de wh Le FoodNet, le système national de surveillance sentinelle aux Etats-Unis, a constaté que% des foyers de gastro-entérite d’étiologie connue étaient causés par des NLV. Malgré tout, les professionnels de la santé ne testent généralement pas les VNR, et les VNB restent sous-estimés en tant que cause des éclosions de gastro-entérite. En effet, seules les éclosions de gastro-entérite signalées aux CDC ont été classées comme étant causées par des VNR. Par conséquent, bien que la disponibilité accrue d’outils de diagnostic plus sensibles au cours des dernières années ait contribué à augmenter le nombre de foyers d’infection à VLN qui ont été diagnostiqués, relativement peu de maladies infectieuses ont été diagnostiquées. Les laboratoires sont en mesure de poser un diagnostic approprié Un meilleur accès à la technologie et à l’éducation est clairement nécessaire Plus récemment, les NLV sont une cause fréquente de maladies gastro-intestinales endémiques dans les pays développés. Dans une étude néerlandaise récente, le NLV était la principale cause de diarrhée. communauté, avec% de patients testés positifs pour le NLV , bien que la fraction de ces cas causée par des aliments contaminés était inconnue En outre, bien que l’on pensait autrefois qu’il causait la maladie principalement chez les adultes, le VNL est clairement une infection commune à tous les groupes d’âge. Par exemple, une étude récente au Japon a montré que% des hospitalisations pour gastro-entérite chez les enfants En Finlande, les NLV étaient la deuxième cause la plus fréquente de diarrhée aiguë après le rotavirus parmi une cohorte d’enfants enrôlés dans un essai sur le rotavirus . les personnes âgées présentent un risque plus élevé de maladies associées au VNL et probablement de maladies plus sévères Cela peut être dû à la survenue d’épidémies d’infection dans des milieux assistés ou à un biais de déclaration en raison de la sévérité accrue de ces personnes. Bien que l’incidence des maladies associées à la VNL soit maximale durant les mois d’hiver dans les pays tempérés , cette tendance est moins prononcée que celle des infections à rotavirus et à astrovirus NLV diagnostiquées toute l’année aux États-Unis.

Options de diagnostic

La principale raison de la sous-estimation du fardeau de l’infection par le NLV réside dans la difficulté de développer et d’appliquer des tests diagnostiques sensibles et faciles à réaliser. Le virus ne peut pas être cultivé à partir d’échantillons cliniques. VNI Jusqu’à récemment, les méthodes de diagnostic primaires étaient la microscopie électronique, une technique relativement peu sensible qui nécessite un équipement et une expertise coûteux, et des tests sérologiques, disponibles uniquement dans les laboratoires de référence et qui utilisent des réactifs provenant de volontaires humains. la microscopie a été progressivement remplacée par la RT-PCR plus sensible et spécifique utilisée pour détecter le génome viral dans les échantillons cliniques habituellement des échantillons de selles. Des tests ont également été développés pour détecter le génome viral dans les coquillages qui accumulent le VNR dans l’eau contaminée. enquêtes épidémiologiques en reliant les cas les uns aux autres et à un commun si Par exemple, des NLV avec des séquences identiques ont été trouvés dans des cas de grappes de gastro-entérite dans les états et dans les huîtres impliquées Les tests de détection des NLV doivent être adaptés à chaque aliment particulier. Même si la RT-PCR nécessite un équipement et une expertise coûteux et prend du temps, un nombre croissant de départements de santé et de laboratoires universitaires des États-Unis utilisent actuellement cette technique, aidée par des efforts récents. Actuellement, les laboratoires de santé publique nationaux et locaux ont la capacité technique de diagnostiquer l’infection par le VNL. Néanmoins, le dépistage des VNL reste limité aux laboratoires de santé publique pendant les flambées d’infection, et les tests ne sont pas systématiquement disponibles pour les laboratoires. clinicienLa variabilité génétique des VNL et l’absence de réaction croisée significative entre les souches la sensibilité des méthodes de détection des antigènes pour les NLV, qui tendent à être spécifiques à la souche. Les efforts pour caractériser les souches actuellement en circulation des souches NLV et pour détecter les épitopes communs devraient permettre le développement de tests largement réactifs

Traitement et prévention

Aucune thérapie spécifique existe pour la gastro-entérite virale. La thérapie pour les symptômes consiste en le remplacement des liquides perdus et la correction des perturbations électrolytiques par l’administration orale et intraveineuse de fluides Bien que plusieurs vaccins contre le rotavirus soient en retard de développement, ils ne seront pas importants. En raison de l’impossibilité de cultiver les VNR, la plupart de ces travaux ont porté sur des particules pseudo-virales exprimées de manière recombinante qui ne se répliquent pas. Ces particules virales se sont avérées immunogènes chez l’homme lorsqu’elles sont administrées. par voie orale et, curieusement, également lorsqu’il est livré dans des pommes de terre transgéniques, ce qui soulève la possibilité d’un vaccin comestible On ne sait pas actuellement si une immunité protectrice est induite, et l’absence d’un système de culture ne permet pas de mesurer les niveaux d’anticorps neutralisants. est l’espoir que les particules de virus des NLV induiront des réponses d’anticorps avec plus de réactivité croisée que l’infection par le virus vivant La prévention de la NLV d’origine alimentaire réside dans la fourniture d’aliments et d’eau sûrs. Les VNR sont plus résilients que les autres pathogènes gastro-entériques; ils sont capables de survivre à des températures allant jusqu’à 0 ° C et ils ont même été associés à la maladie après avoir été cuits à la vapeur dans des coquillages. En outre, les VNL peuvent survivre jusqu’à des ppm, ce qui dépasse largement les niveaux les systèmes d’eau Cependant, malgré cela, il est probable que des mesures simples, comme la manipulation correcte des aliments froids, le lavage fréquent des mains et les congés de maladie payés, réduiront considérablement la transmission alimentaire de l’infection par le NLV

Directions futures

Le développement récent de tests diagnostiques améliorés et de surveillance contribue à définir la nature et l’étendue de la maladie du VNL. Les prochaines années seront probablement dominées par la recherche visant à définir la charge de morbidité liée aux VNL, qui, nous l’espérons, sera favorisée Des tests diagnostiques simples, sensibles et spécifiques De plus, le développement de vaccins continuera parallèlement aux études épidémiologiques pour définir les groupes ayant le plus besoin de vaccination. Des efforts réussis pour cultiver des VNL en culture cellulaire seront une percée majeure pour le développement de vaccins et révolutionneront les stratégies diagnostiques La culture cellulaire permettra également aux études d’inactivation d’examiner la stabilité des VNL à la température, aux désinfectants et aux procédés industriels. Une autre étape importante sera l’évolution des tests pour détecter de manière fiable la contamination par les VNL dans différents aliments. plus important pour les autorités de santé publique, mais ils rendra également les VNL de plus en plus pertinents pour les cliniciens dans un avenir proche. Toutefois, la communication à la communauté de santé publique de ce que l’on sait déjà sur les VNR et la mise en œuvre de mesures simples de contrôle des infections demeurera une priorité